当约瑟夫•普里斯特利(Joseph Priestley)向他的朋友们提供这种原本旨在杀死老鼠的甜味清新碳酸水时，他几乎不知道自己正在制造过多的争议。两个多世纪后，碳酸水和非碳酸水之间的相对健康差异仍然是一个激烈争论的话题。尽管多年来双方都有争论，但碳酸水和非碳酸水之间的健康差异在很大程度上仍然是模棱两可的。
碳酸饮料的受欢迎程度
关于碳酸水和非碳酸水之间健康差异的争论掩盖了许多人转向碳酸饮料的主要原因。实际上，人们是出于健康原因才喜欢碳酸水的。事实上，碳酸水的味道很好，没有糖、着色剂、防腐剂和甜味剂，这让它对注重健康的人很有吸引力——当然，直到相互矛盾的研究报告开始表明相反的观点。
水与健康
每个身体系统都依赖水的自然形态来运作。身体系统的pH值或酸度是由足够的水平衡来维持的，血液的粘度或厚度与水合作用的水平直接相关。虽然有人认为碳酸水可以起到这些作用，因为它与非碳酸水的不同之处在于其二氧化碳含量，但在许多方面，人们担心情况可能并非如此。
碳酸水问题
水合作用似乎是碳酸水和非碳酸水之间最重要的健康差异。有人认为，碳酸水会对肾脏造成压力，导致脱水的风险。脱水会导致许多健康问题，如便秘、膀胱感染、类风湿关节炎和骨质疏松症。碳酸水是否能给身体充分补水引起了人们的严重关注，并已成为许多研究的主题。2002年9月的一项研究发现碳酸水有助于缓解便秘，这一事实进一步增加了争议。
渐进范式转移
伯明翰大学的牙医研究了碳酸水导致牙齿腐蚀的能力。他们没有发现任何关联。此前被认为是导致碳酸饮料脱水的罪魁祸首的咖啡因也被证明无罪。2000年10月发表在《美国营养学院杂志》上的一项著名研究报告称，碳酸水、咖啡因和脱水之间没有联系。美国国家骨质疏松基金会也指出，不像以前认为的那样，碳酸水不会导致骨质疏松。
危险和好处
令人惊讶的是，研究已经确定了碳酸水的一些健康益处，例如胃灼热和便秘的缓解以及改善的胆囊排放。2004年5月的研究报告说，富含钠的碳酸水降低了绝经后妇女的心血管风险。然而，尽管存在这些阳性结果，但根据碳酸水作为主要流体来源是不可取的，因为研究报告了碳酸饮料和食管刺激，胃流回流和肠易激综合征之间的关联。