菠萝和菠萝汁中含有菠萝蛋白酶，这是一种蛋白质消化酶的组合，在其他地方是找不到的。马里兰大学医学中心称，历史上，南美洲的人们用菠萝来治疗胃病和炎症。现代科学研究人员已经检验了菠萝蛋白酶治疗多种疾病的疗效，但还需要进一步的研究来确定这些疾病的潜在价值和推荐的剂量/给药方法。服用菠萝蛋白酶治疗任何疾病前请咨询医生。
新鲜菠萝汁与菠萝蛋白酶补充剂
UMMC建议用菠萝蛋白酶片代替新鲜菠萝汁，声称菠萝汁中菠萝蛋白酶的浓度不够，不足以产生效果。然而，多尔营养实验室不同意这种说法，他们解释说，新鲜的、甚至冷冻的菠萝汁比6种菠萝蛋白酶补充剂显示出更强的酶活性。这些研究人员指出，除了菠萝蛋白酶，菠萝汁也是维生素C和锰的极佳来源。
菠萝蛋白酶对关节炎
菠萝蛋白酶的实用性治疗关节炎仍然是一个问题。发表在医学杂志“QJM”的2006年12月发表的一项研究发现，每天菠萝蛋白酶800毫克对膝关节骨性关节炎没有影响。然而，科学家们发现，患者的髋关节疼痛是骨性关节炎的症状经历了类似的改进，他们是否采取了非甾体类抗炎药或口服酶制剂，其菠萝蛋白酶，胰蛋白酶和芸香苷的组合，报告的2006年1 - 2月的问题“临床与实验风湿病“。
用菠萝蛋白酶止痛
对于一般的止痛效果，菠萝蛋白酶的作用还不确定。发表在2002年12月《植物医学》杂志上的一项研究发现，每天服用200毫克和400毫克的菠萝蛋白酶有助于减轻健康成年人的膝盖疼痛。然而，发表在2002年11月《运动医学临床杂志》上的一项研究发现，布洛芬和菠萝蛋白酶都不能帮助研究对象减轻延迟发作性肌肉酸痛。
用于消肿和消炎的菠萝蛋白酶
菠萝蛋白酶有望治疗肿胀和炎症。根据2011年1月出版的《植物疗法研究》杂志上的一项研究，口服菠萝蛋白酶补充剂可以加速急性肌腱损伤大鼠的愈合。UMMC states that bromelain may shorten the healing time for sports injuries, surgical procedures, burns and wounds. When applied directly to the skin, bromelain might also help lessen swelling from bug bites and stings.
菠萝蛋白酶有更多可能的用途
2005年3 - 4月《体内》杂志报道的一项研究得出结论，菠萝蛋白酶显著改善了儿童鼻窦炎的症状。Bromelain也可能增加抗生素的吸收，MedlinePlus解释说，除了可能抑制肿瘤生长和减少血凝块。UMMC指出，其他潜在的应用包括使用菠萝蛋白酶来对抗病毒和细菌感染、花粉热、胃灼热、肠易激综合症和其他消化系统疾病。