根据美国疾病控制和预防中心(CDC)的数据，每年有5%到20%的美国人感染流感病毒。流感会引发一系列疾病，从轻微的自限性呼吸道疾病到危及生命的肺炎。流感主要影响免疫系统、呼吸系统和消化道。

免疫系统

免疫系统对抗由流感和其他病毒、细菌、真菌和寄生虫引起的感染。根据《哈里森内科学原理》，细胞因子是免疫系统中t细胞、b细胞和自然杀伤细胞在应对流感感染时发出的一种化学求救信号。大多数系统症状，比如发烧，肌肉疼痛和头痛，这些都与感染有关实际上反映了免疫系统释放这些细胞因子。细胞因子会提示大脑中的下丘脑提高体温，从而降低病毒复制中的酶的活性。细胞因子还会激活大脑血管中的受体，导致头痛，并导致肌肉中的疼痛纤维断裂，从而导致非特异性肌肉疼痛和酸痛。细胞因子的释放与免疫系统反应成正比。因此，随着感染消退，全身症状也会消退。

呼吸系统

流感的后遗症

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根据美国国立卫生研究院的说法，流感主要是一种呼吸道病毒，会产生上呼吸道和下呼吸道症状。下呼吸道症状包括咳嗽和呼吸问题。上呼吸道症状包括喉咙痛、流鼻涕和充血。流感感染的实验模型显示，病毒诱导呼吸道内膜细胞死亡。这些死去的细胞脱落，使病毒能够感染进展的细胞层。流感的呼吸道症状与一个人感染的病毒的“剂量”成正比。病毒也像工厂一样利用人自己的细胞进行复制。对于免疫反应迟缓或有缺陷的人，初始的小剂量会由于生长不受抑制而产生大的影响。

消化系统

季节性流感与食欲不振有关。这被认为是细胞因子对大脑食欲中心的二次作用。此外，呼吸道症状如喉咙痛和流鼻水，会使吞咽疼痛和产生后滴鼻引起的恶心，从而降低食欲。季节性流感很少伴有其他胃肠道症状，如呕吐或腹泻。然而，新型H1N1或猪流感在这方面似乎也有所不同。根据新成立的甲型H1N1流感病毒调查小组2009年发表在《新英格兰医学杂志》上的一份报告，近40%的经实验室确诊的猪流感患者报告出现呕吐、腹泻或两者同时出现的情况2。与猪流感对身体其他系统的影响相比，这些症状比较温和且短暂。